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猪 · 遗传育种 · 基因组选择

小猪选秀记

早期选择,就是在小猪刚出生、还没长大的时候,先读它的 DNA,预测它将来长得快不快、膘薄不薄、能不能多生崽,把好苗子早早挑出来重点培养。

全流程 8 步

从出生到配种,一步一步看

点任意一步看详情,或者按“自动播放”,让小猪自己走一遍。每一步都配了比喻,方便记忆。

    层层筛选

    100 头小公猪,最后留下几头?

    选种像一个漏斗。早期选择最大的价值,是在断奶这一步就把一半以上的候选筛掉,测定栏位和饲料只花在最有希望的猪身上。

    数字为示意,各场留种比例不同。没选上的猪转入商品群正常育肥,并不浪费。
    为什么要“早”

    遗传进展公式:动手拖一拖

    育种学里有一个核心公式,衡量每年能把猪群“改良”多少。早期选择主要改了两个量:准确性 r 变高(DNA 信息更多),世代间隔 L 变短(更早选、更早配种)。

    每年遗传进展 ΔG = i × r × σA ÷ L
    留得越少,选择强度 i 越大。当前 i =
    群体里“遗传底子”的差异有多大,差异越大越好选。

    传统选择(系谱 + 测定)

    断奶时只有父母信息,同窝兄弟分不出高低,要等测定完才知道。

    基因组早期选择

    出生后就有 DNA 打分,测定后再结合自身成绩复算。
    传统
    早期选择

    按这组参数,每年遗传进展约提高

    默认参数只是示意的典型量级,单位是“遗传标准差/年”。真实数值因性状、品种、参考群大小而不同。

    挑什么

    常看的性状,以及早期选择帮了什么忙

    有些性状要等很久、甚至种猪本身永远测不到。这类性状,DNA 提前打分的价值最大。

    性状主要用于什么时候才测得到早期选择的作用
    总产仔数 / 活仔数母系母猪第一胎分娩后(约 1 岁)公猪自己不生崽,测不到;遗传力低,靠 DNA 提前估计,提升最明显
    有效乳头数母系出生当天出生就能数,直接作为第一道门槛
    达 100 kg 日龄父系 母系约 5 月龄测定结束断奶前就有预估排名,决定谁进测定
    背膘厚、眼肌面积父系测定结束时 B 超同上,测完后再合并自身数据复算
    饲料转化率(料重比)父系测定期,需自动饲喂站设备贵、栏位少,先用 DNA 筛,再测最有希望的
    肉质(肌内脂肪、pH 等)终端屠宰后种猪不能屠宰,只能靠亲属屠宰数据和 DNA 来估计
    和动物模型的关系

    DNA 到底让计算多知道了什么?

    打分用的仍是熟悉的动物模型。区别只在“亲缘关系矩阵”用什么来算。

    y = Xb + Za + e

    y 是测到的成绩,b 是场、季节、性别这类环境因素,a 是每头猪的育种值,e 是误差。育种值之间的相关由一个矩阵描述:

    • 传统 BLUP:用系谱算的 A 矩阵
    • GBLUP:用 SNP 算的 G 矩阵
    • 一步法 ssGBLUP:两者合成 H 矩阵,没测 DNA 的猪也能用上

    同窝三兄弟的亲缘关系

    10.500.500.5010.500.500.501

    系谱 A:全同胞一律 0.50

    1.010.580.440.580.980.470.440.471.03

    基因组 G:实际共享多少看得见

    系谱只知道“同父同母”,所以断奶时三兄弟的育种值完全一样,没法挑。DNA 能看出谁从父母那里继承到了更好的那一半,这就是早期能分出高下的根本原因。(G 矩阵数字为示意)

    常见疑问

    三个常被问到的问题

    早期选择会不会选错?

    会有误差,所以它叫“初选”。DNA 打分把明显差的先筛掉,测定后再用自身成绩复算一次,两轮把关。参考群越大、和候选猪亲缘越近,预测越准。

    有了 DNA,还要做性能测定吗?

    要。测定数据是参考群的“养料”,没有新成绩,DNA 和性状之间的规律会随世代慢慢失效,预测准确性下降。

    为什么采样放在 1 周内?

    能和打耳号、剪牙、断尾同时做,少抓一次猪;也给实验室留出时间,保证断奶前拿到结果,赶上初选。